Biofilmový reaktor je zařízení využívané nejčastěji v čištění odpadních vod, kde mikroorganismy nerostou volně ve vodě, ale tvoří přisedlý povlak (biofilm) na pevném nosiči. Tyto systémy jsou vysoce efektivní, odolné vůči kolísání znečištění a zabírají méně prostoru než jiné metody.